RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ADSSL1Q8N142 457 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TMEM174Q8WUU8 243 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SCLT1Q96NL6 688 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SIP14410 1827 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 DENND3A2RUS2 1198 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SFI1A8K8P3 1242 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 IKBKBO14920 756 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 RSPH10BP0C881 870 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CCNE1P24864 410 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 AXLP30530 894 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ZNF165P49910 485 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GPC3P51654 580 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CLCN3P51790 818 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 RBL2Q08999 1139 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PAK1Q13153 545 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CAPSQ13938 189 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NFIL3Q16649 462 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM187BQ17R55 369 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ZPBP2Q6X784 338 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 RNF149Q8NC42 400 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NLRP7Q8WX94 980 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 STRA6Q9BX79 667 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GBP3Q9H0R5 595 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TBX20Q9UMR3 447 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GRIN2DO15399 1336 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 BECN2A8MW95 431 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ACKR2O00590 384 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SLC16A4O15374 487 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PPP1R37O75864 691 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GNA14O95837 355 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PRCPP42785 496 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 KYAT1Q16773 422 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM26DQ5JW98 314 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CENPPQ6IPU0 288 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM114A1Q8IWE2 563 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM126BQ8IXS8 530 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 SCFD1Q8WVM8 642 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 DNAJB3Q8WWF6 145 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 P2RX5Q93086 422 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NLRP4Q96MN2 994 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FZD8Q9H461 694 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 TRPV2Q9Y5S1 764 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GPR182O15218 404 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GPR32O75388 356 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 ERLIN2O94905 339 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 LDHAP00338 332 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 CD4P01730 458 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 PIGRP01833 764 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 BMP6P22004 513 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 GARTP22102 1010 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 NMT1P30419 496 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 THPOP40225 353 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-220ENST00000550700 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
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