RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 MAP2K5Q13163 448 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ACVR2BQ13705 512 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 DUSP28Q4G0W2 176 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ZNF484Q5JVG2 852 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TMEM63BQ5T3F8 832 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TCERG1LQ5VWI1 586 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TRIM65Q6PJ69 517 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ZNF662Q6ZS27 426 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 RRAGAQ7L523 313 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ASAP3Q8TDY4 903 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 USP6NLQ92738 828 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TMEM143Q96AN5 459 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 HHIPL1Q96JK4 782 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 FBXL18Q96ME1 805 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 CBWD1Q9BRT8 395 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 GANQ9H2C0 597 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 STYXL1Q9Y6J8 313 aa10.67□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ZBTB42B2RXF5 422 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ASAP2O43150 1006 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SLC9A1P19634 815 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 VAMP7P51809 220 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 KRT83P78385 493 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SREBF2Q12772 1141 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 BFSP1Q12934 665 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 PPTC7Q8NI37 304 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 KIF18AQ8NI77 898 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 DEPTORQ8TB45 409 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TMC2Q8TDI7 906 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 MFSD14AQ96MC6 490 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 CRACR2AQ9BSW2 395 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 DESI2Q9BSY9 194 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 KIFC3Q9BVG8 833 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 KIAA1586Q9HCI6 787 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ERAP1Q9NZ08 941 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 AIPL1Q9NZN9 384 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 USP20Q9Y2K6 914 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa10.66□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 LRRC53A6NM62 1247 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 TISP43B9A030 160 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 K7ERI5 159 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 MAGEB2O15479 319 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ADCY3O60266 1144 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 LCA5LO95447 670 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SMPD1P17405 629 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 ADCYAP1R1P41586 468 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EFNA5P52803 228 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 STRN3Q13033 797 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SLFN12LQ6IEE8 588 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SLC39A4Q6P5W5 647 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 RDH13Q8NBN7 331 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SMC1BQ8NDV3 1235 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 VTI1AQ96AJ9 217 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 CCDC42Q96M95 316 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 SIX2Q9NPC8 291 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 GJD2Q9UKL4 321 aa10.65□□□□□ -0.7
CS-209ENST00000547449 EXTL3O43909 919 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 IGHA2P01877 340 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 SERPING1P05155 500 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 LGALS2P05162 132 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 UCHL3P15374 230 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 GTF2H1P32780 548 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 ARHGAP25P42331 645 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 POU5F1BQ06416 359 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 CETN1Q12798 172 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 C1orf220Q5T0J3 134 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 HGSNATQ68CP4 663 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 ZPBP2Q6X784 338 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 USP37Q86T82 979 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 TRIM50Q86XT4 487 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-209ENST00000547449 GPD1LQ8N335 351 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms