RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546215.5

SCARB1-211, Transcript of scavenger receptor class B member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB1, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB1-211ENST00000546215 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.96■■□□□ 1.27
SCARB1-211ENST00000546215 EFCAB14O75071 495 aa22.96■■□□□ 1.27
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SCARB1-211ENST00000546215 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SCARB1-211ENST00000546215 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SCARB1-211ENST00000546215 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.96■■□□□ 1.27
SCARB1-211ENST00000546215 DEPTORQ8TB45 409 aa22.96■■□□□ 1.27
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SCARB1-211ENST00000546215 MYCT1Q8N699 235 aa22.93■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.93■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 CASP1P29466 404 aa22.92■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.92■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.92■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 UBE2HP62256 183 aa22.91■■□□□ 1.26
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SCARB1-211ENST00000546215 KCNN1Q92952 543 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 GBP4Q96PP9 640 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 PTPRSQ13332 1948 aa22.91■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 K7ERI5 159 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 NR1I2O75469 434 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 CUL4BQ13620 913 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 SFR1Q86XK3 245 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 FAM178BQ8IXR5 827 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 PANK4Q9NVE7 773 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.9■■□□□ 1.26
SCARB1-211ENST00000546215 C9IYK1 514 aa22.89■■□□□ 1.26
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