RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EDAR	Q9UNE0	448 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SYNJ1	O43426	1573 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS38	A1L453	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXP2	O15409	715 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SGSM2	O43147	1006 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	C8B	P07358	591 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	MME	P08473	750 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	HSPA6	P17066	643 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP5	P24588	427 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD11	Q96NU1	681 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	TOPBP1	Q92547	1522 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SNHG1-222	ENST00000545308	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58	5e-14	■■■■■ 43.1
SNHG1-222	ENST00000545308	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MATN3	O15232	486 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PLAT	P00750	562 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	LPL	P06858	475 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MYB	P10242	640 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	USP14	P54578	494 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ZXDA	P98168	799 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	GRIN1	Q05586	938 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ADCY1	Q08828	1119 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CHRNA2	Q15822	529 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS72	Q15906	364 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	UGT8	Q16880	541 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PHOSPHO1	Q8TCT1	267 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	HPS3	Q969F9	1004 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	POFUT1	Q9H488	388 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	5.21	□□□□□ -1.58	1e-323	■■■□□ 15.6
SNHG1-222	ENST00000545308	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM50B	Q9Y247	325 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR97	A6NE52	1622 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MAFK	O60675	156 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	NDUFS2	O75306	463 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	OFD1	O75665	1012 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	POU2F2	P09086	479 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	THBS2	P35442	1172 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MYBPC3	Q14896	1274 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C7orf31	Q8N865	590 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	SEC14L1	Q92503	715 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	LOXL4	Q96JB6	756 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	GBP4	Q96PP9	640 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MYL10	Q9BUA6	226 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	CSRNP2	Q9H175	543 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SNHG1-222	ENST00000545308	ANO9	A1A5B4	782 aa		5.19	□□□□□ -1.58

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