RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB5O15062 677 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRD-214ENST00000540109 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GDAP1Q8TB36 358 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.373e-12■■■■■ 70.5
PTPRD-214ENST00000540109 OPTNQ96CV9 577 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 MPP4Q96JB8 637 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRD-214ENST00000540109 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.48□□□□□ -1.37
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