RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533096.5

COPB1-209, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 1, humanhuman

TSL 4

Gene COPB1, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1-209ENST00000533096 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.67□□□□□ -0.06
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COPB1-209ENST00000533096 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.66□□□□□ -0.06
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COPB1-209ENST00000533096 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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COPB1-209ENST00000533096 BICD2Q8TD16 824 aa14.65□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
COPB1-209ENST00000533096 LENG9Q96B70 501 aa14.65□□□□□ -0.06
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COPB1-209ENST00000533096 ESYT2A0FGR8 921 aa14.64□□□□□ -0.07
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COPB1-209ENST00000533096 USP11P51784 963 aa14.64□□□□□ -0.07
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COPB1-209ENST00000533096 TMEM143Q96AN5 459 aa14.62□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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COPB1-209ENST00000533096 LILRB3O75022 631 aa14.61□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 RFPL2O75678 378 aa14.61□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 TDP2O95551 362 aa14.61□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COPB1-209ENST00000533096 URODP06132 367 aa14.61□□□□□ -0.07
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