RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 CLCN3P51790 818 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CHMP4BP1P59074 171 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPSQ13938 189 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SETD4Q9NVD3 440 aa24.11■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CALUO43852 315 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 NR3C1P04150 777 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ASGR1P07306 291 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 NR2F2P24468 414 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SPAG1Q07617 926 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ALCAMQ13740 583 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 GRIK4Q16099 956 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MTHFD1LQ6UB35 978 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 METTL13Q8N6R0 699 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 GBP3Q9H0R5 595 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 USP20Q9Y2K6 914 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CABYRO75952 493 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 NAMPTP43490 491 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CASP4P49662 377 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 PPFIA1Q13136 1202 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CEP63Q96MT8 703 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 DMAC2Q9NW81 257 aa24.1■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD63C9JTQ0 380 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 PSEN2P49810 448 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MFSD10Q14728 455 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC17A8Q8NDX2 589 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 COL1A2P08123 1366 aa24.09■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 LRRIQ4A6NIV6 560 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CBFA2T2O43439 604 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 GAS2O43903 313 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 ACLYP53396 1101 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MIIPQ5JXC2 388 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 MAP4K3Q8IVH8 894 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 DRC7Q8IY82 874 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TCP11Q8WWU5 503 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM206Q9H813 350 aa24.08■■□□□ 1.45
PACSIN3-209ENST00000532457 CETN3O15182 167 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 AKAP3O75969 853 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 NFIL3Q16649 462 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC39A4Q6P5W5 647 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 N4BP3O15049 544 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 MAGEB2O15479 319 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 EDN1P05305 212 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 ADSSP30520 456 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP2R5AQ15172 486 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 RHPN2Q8IUC4 686 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PHF24Q9UPV7 400 aa24.07■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PBX1P40424 430 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 VSTM4Q8IW00 320 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 DEPTORQ8TB45 409 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNN1Q92952 543 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 VTI1AQ96AJ9 217 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 HVCN1Q96D96 273 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.06■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 ADAM17P78536 824 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 TMC6Q7Z403 805 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 RNF149Q8NC42 400 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 RETREG2Q8NC44 543 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 BORCS6Q96GS4 357 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 KAT6AQ92794 2004 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 TTLL13PA6NNM8 815 aa24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PACSIN3-209ENST00000532457 CYP2J2P51589 502 aa24.05■■□□□ 1.44
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