RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518136.3

HOXA13-202, Transcript of homeobox A13, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA13, Length 871 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13-202ENST00000518136 TXLNAP40222 546 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF445P59923 1031 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TNFAIP2Q03169 654 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 KIF22Q14807 665 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 POSTNQ15063 836 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ANO5Q75V66 913 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TPH2Q8IWU9 490 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 NEK9Q8TD19 979 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 AFG1LQ8WV93 481 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CALML4Q96GE6 196 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SPATA33Q96N06 139 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 TNMDQ9H2S6 317 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GPAMQ9HCL2 828 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 CCDC39Q9UFE4 941 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 USP25Q9UHP3 1055 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 EMSYQ7Z589 1322 aa9.28□□□□□ -0.92
HOXA13-202ENST00000518136 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PRMT3O60678 531 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 EYA4O95677 639 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GH1P01241 217 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PSAPP07602 524 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MMP3P08254 477 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CYP11B2P19099 503 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MUTP22033 750 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 IGFBP4P22692 258 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MSX1P28360 303 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 WEE1P30291 646 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NPEPPSP55786 919 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PSMC5P62195 406 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PRKCEQ02156 737 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 EHHADHQ08426 723 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MAPK7Q13164 816 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TLK2Q86UE8 772 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C4orf19Q8IY42 314 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PPTC7Q8NI37 304 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ERMNQ8TAM6 284 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PRIMPOLQ96LW4 560 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TRIM9Q9C026 710 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NT5C3AQ9H0P0 336 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 POLD4Q9HCU8 107 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SAMM50Q9Y512 469 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 H3BM21 787 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 BIN1O00499 593 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HMGCRP04035 888 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 LGALS2P05162 132 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RSPH10BP0C881 870 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 ZNF286BP0CG31 522 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RARRES1P49788 294 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 NKX3-2P78367 333 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 LAMC2Q13753 1193 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RINT1Q6NUQ1 792 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 GPBP1Q86WP2 473 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 DAW1Q8N136 415 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 KAT2BQ92831 832 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 HPS3Q969F9 1004 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 MED15Q96RN5 788 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
HOXA13-202ENST00000518136 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms