RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511273.1

CDH18-210, Transcript of cadherin 18, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CDH18, Length 2,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-210ENST00000511273 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 APOL6Q9BWW8 343 aa7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 EBF1Q9UH73 591 aa7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.3□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 GRIK4Q16099 956 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PMS2CLQ68D20 193 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PARM1Q6UWI2 310 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 CHST3Q7LGC8 479 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 CCDC26Q8TAB7 109 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 FGF14Q92915 247 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 C8AP07357 584 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 USH1GQ495M9 461 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 LRRC55Q6ZSA7 311 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 CEP95Q96GE4 821 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
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CDH18-210ENST00000511273 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ERAP1Q9NZ08 941 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ZZEF1O43149 2961 aa7.29□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 OPHN1O60890 802 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 RPS6KA5O75582 802 aa7.28□□□□□ -1.24
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CDH18-210ENST00000511273 CA8P35219 290 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 HSDL1Q3SXM5 330 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 C4orf17Q53FE4 359 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 FAM102BQ5T8I3 360 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ARHGEF16Q5VV41 709 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 LCORLQ8N3X6 602 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 RMDN3Q96TC7 470 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PXMP2Q9NR77 195 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.28□□□□□ -1.24
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CDH18-210ENST00000511273 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.28□□□□□ -1.24
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CDH18-210ENST00000511273 KRT76Q01546 638 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 PCSK4Q6UW60 755 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 MDM1Q8TC05 714 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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CDH18-210ENST00000511273 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.28□□□□□ -1.24
CDH18-210ENST00000511273 TNFRSF10BO14763 440 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SPEGQ15772 3267 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 BROXQ5VW32 411 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CTR9Q6PD62 1173 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ECHDC2Q86YB7 292 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ENGASEQ8NFI3 743 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SDR42E1Q8WUS8 393 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 B4GALT3O60512 393 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ZNF883P0CG24 379 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SFTPCP11686 197 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PTPAQ15257 358 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 UBE3CQ15386 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 DACT1Q9NYF0 836 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.27□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SRGAP3O43295 1099 aa7.26□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 SLC26A2P50443 739 aa7.26□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 RAB27AP51159 221 aa7.26□□□□□ -1.25
CDH18-210ENST00000511273 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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