RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PRSS50	Q9UI38	385 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	NRP1	O14786	923 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	FOXS1	O43638	330 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TOX4	O94842	621 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	RIN1	Q13671	783 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CT83	Q5H943	113 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	KLC2	Q9H0B6	622 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MUSK	O15146	869 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MTSS1	O43312	755 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	LPL	P06858	475 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	GAA	P10253	952 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MTHFD2	P13995	350 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF20	P17024	532 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ENPP1	P22413	925 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	NPEPPS	P55786	919 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	LGALS4	P56470	323 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CD69	Q07108	199 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MGAT5	Q09328	741 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PDCD1	Q15116	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ARL8A	Q96BM9	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		4.23	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CYP27B1	O15528	508 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PRKD3	O94806	890 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	LY86	O95711	162 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SCAND1	P57086	179 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	DUSP8	Q13202	625 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	EDA	Q92838	391 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
ATXN3-208	ENST00000504047	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	WNT3A	P56704	352 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	FOXL1	Q12952	345 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ACAP1	Q15027	740 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PALM2	Q8IXS6	379 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
ATXN3-208	ENST00000504047	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

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