RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 RAB27AP51159 221 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 EPHA7Q15375 998 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 LONRF3Q496Y0 759 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 C4orf19Q8IY42 314 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 LXNQ9BS40 222 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 FAM205CA6NFA0 338 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF623O75123 536 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 AK2P54819 239 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 ANAPC15P60006 121 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 SPIRE1Q08AE8 756 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 CASP10Q92851 521 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 TMEM169Q96HH4 297 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 APOL5Q9BWW9 433 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.96■■■□□ 2.23
CUL4A-211ENST00000498562 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 RFC5P40937 340 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NOMO2Q5JPE7 1267 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 GLB1LQ6UWU2 654 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 EXOC8Q8IYI6 725 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZBP1Q9H171 429 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 KCNH6Q9H252 994 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 RGL1Q9NZL6 768 aa28.95■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 YWHABP31946 246 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZXDAP98168 799 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NR5A1Q13285 461 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ANKRD1Q15327 319 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NCAPH2Q6IBW4 605 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TRIM67Q6ZTA4 783 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 WASF1Q92558 559 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TNFRSF25Q93038 417 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TMEM143Q96AN5 459 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 DYDC2Q96IM9 177 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 MFSD14AQ96MC6 490 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa28.94■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 OFD1O75665 1012 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 VPS52Q8N1B4 723 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 IGSF21Q96ID5 467 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 FBXL18Q96ME1 805 aa28.93■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CARNS1A5YM72 827 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 MARCH6O60337 910 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 LARGE1O95461 756 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 GALTP07902 379 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 KRT2P35908 639 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 EMC2Q15006 297 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CDH22Q9UJ99 828 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa28.92■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TMEM221A6NGB7 291 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 M0R296 226 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZBTB39O15060 712 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 B4GALT3O60512 393 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CXCL14O95715 111 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NEFLP07196 543 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CA8P35219 290 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CYP4A11Q02928 519 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ME3Q16798 604 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 OTUD6AQ7L8S5 288 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 NECAB1Q8N987 351 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 PGBD4Q96DM1 585 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJB4Q9UDY4 337 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 IRAK3Q9Y616 596 aa28.91■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BAG4O95429 457 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 XKR9Q5GH70 373 aa28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 FERMT3Q86UX7 667 aa28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 TCP11Q8WWU5 503 aa28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 GTF3C6Q969F1 213 aa28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 BRMS1Q9HCU9 246 aa28.9■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 CTSAP10619 480 aa28.89■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 SLC11A1P49279 550 aa28.89■■■□□ 2.22
CUL4A-211ENST00000498562 UBXN11Q5T124 520 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms