RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 FERP16591 822 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 KLRC1P26715 233 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 ICAM3P32942 547 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 STK33Q9BYT3 514 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 APEX2Q9UBZ4 518 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 MYH10P35580 1976 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 SOX5P35711 763 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 MTERF2Q49AM1 385 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 VPS36Q86VN1 386 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.21■□□□□ 0.51
TOM1-216ENST00000492723 EVI5O60447 810 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 GCLMP48507 274 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PPP3CAQ08209 521 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 XKR3Q5GH77 459 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 C10orf76Q5T2E6 689 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 HVCN1Q96D96 273 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PNKPQ96T60 521 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 NAGPAQ9UK23 515 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 SOWAHBA6NEL2 793 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 SPDYE5A6NIY4 337 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CXCL11O14625 94 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 NCK2O43639 380 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CNGA1P29973 690 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ADSSP30520 456 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CETN1Q12798 172 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 SAAL1Q96ER3 474 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PSMB7Q99436 277 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ZNF302Q9NR11 478 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 A0A0G2JMZ2 1700 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa18.2■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ARHGAP44Q17R89 818 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 DNAAF5Q86Y56 855 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PLEKHO2Q8TD55 490 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ARID2Q68CP9 1835 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 MAPK13O15264 365 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PALMO75781 387 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ADRB2P07550 413 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 EPHX2P34913 555 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CBWD2Q8IUF1 395 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 LMO3Q8TAP4 145 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 IFT74Q96LB3 600 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 OSBPL9Q96SU4 736 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 HYOU1Q9Y4L1 999 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa18.19■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ANXA13P27216 316 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CXCR5P32302 372 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 COG1Q8WTW3 980 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 GPR88Q9GZN0 384 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CCDC151A5D8V7 595 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CNMDO75829 334 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ATG7O95352 703 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 PRLRP16471 622 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 ATP4AP20648 1035 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 BRD3Q15059 726 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CREG2Q8IUH2 290 aa18.18■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 OATP04181 439 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 TCP1P17987 556 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 EDNRBP24530 442 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 RTP1P59025 263 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 EMC2Q15006 297 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 EEPD1Q7L9B9 569 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 CCDC127Q96BQ5 260 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 OPTNQ96CV9 577 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 TLR10Q9BXR5 811 aa18.17■□□□□ 0.5
TOM1-216ENST00000492723 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81 ms