RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1-208ENST00000489824 VAV3Q9UKW4 847 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 PPME1Q9Y570 386 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 MUC6Q6W4X9 2439 aa21.79■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 C2orf71A6NGG8 1288 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 CXCL14O95715 111 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 RFC5P40937 340 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 NOMO2Q5JPE7 1267 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZBTB33Q86T24 672 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 URGCPQ8TCY9 931 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 FBXL18Q96ME1 805 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 S1PR5Q9H228 398 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 BRMS1Q9HCU9 246 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 TBX3O15119 743 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 BAG4O95429 457 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 NPEPPSP55786 919 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANKRD1Q15327 319 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 VPS52Q8N1B4 723 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 GBP3Q9H0R5 595 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 NR2E1Q9Y466 385 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.77■■□□□ 1.08
RPS6KB1-208ENST00000489824 TRIOO75962 3097 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 PFKFB2O60825 505 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 YWHABP31946 246 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 EPHA7Q15375 998 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SLFN12Q8IYM2 578 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 TCP11Q8WWU5 503 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM143Q96AN5 459 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 LXNQ9BS40 222 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 TBC1D13Q9NVG8 400 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 WDR81Q562E7 1941 aa21.76■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 GAS2O43903 313 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF623O75123 536 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ITIH3Q06033 890 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 GIT2Q14161 759 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 POTEDQ86YR6 584 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 C4orf19Q8IY42 314 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 OXER1Q8TDS5 423 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa21.75■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 OFD1O75665 1012 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 KRT2P35908 639 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 NHLH1Q02575 133 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SIGLEC14Q08ET2 396 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 PTPN21Q16825 1174 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 XKR9Q5GH70 373 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 HAS1Q92839 578 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 IGSF21Q96ID5 467 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ZBP1Q9H171 429 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ADAM7Q9H2U9 754 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ASAP2O43150 1006 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ERLIN2O94905 339 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 GALTP07902 379 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 CTSAP10619 480 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 ANAPC15P60006 121 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 CYP4A11Q02928 519 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 EMC2Q15006 297 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 RNF149Q8NC42 400 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 DYDC2Q96IM9 177 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 RIPOR3Q96MK2 946 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 RGL1Q9NZL6 768 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 KANSL3Q9P2N6 904 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 STK39Q9UEW8 545 aa21.73■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 DTNBO60941 627 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 MTHFRP42898 656 aa21.72■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RPS6KB1-208ENST00000489824 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms