RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 H2AFZP0C0S5 128 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 VPS41P49754 854 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 USP11P51784 963 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KCNMA1Q12791 1236 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 COASYQ13057 564 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 H2AFVQ71UI9 128 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MYOCDQ8IZQ8 938 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 DNAJC18Q9H819 358 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PIDD1Q9HB75 910 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CEP72Q9P209 647 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 C5orf60A6NFR6 353 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MYL1P05976 194 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FAM26FQ5R3K3 315 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SPDYE5A6NIY4 337 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ECHS1P30084 290 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF76P36508 570 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM237Q96Q45 408 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HOMER3Q9NSC5 361 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 RGL2O15211 777 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 APBA3O96018 575 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 ICA1Q05084 483 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLMAPQ14BN4 828 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TNIP1Q15025 636 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SEPT14Q6ZU15 432 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 IQCDQ96DY2 449 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NUDCD1Q96RS6 583 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLC5A4Q9NY91 659 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 CLRN2A0PK11 232 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 KLHL33A6NCF5 533 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 INHBEP58166 350 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 PSMC6P62333 389 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 TAOK1Q7L7X3 1001 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.395e-7■■■■■ 32.4
CCSAP-204ENST00000483092 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-204ENST00000483092 SLC9A1P19634 815 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM33Q9BZ11 813 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PKD2L1Q9P0L9 805 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PLA2G4BP0C869 781 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RARAP10276 462 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CENPPQ6IPU0 288 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC105Q8IYK2 499 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ANO3Q9BYT9 981 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 INTUQ9ULD6 942 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DLEC1Q9Y238 1755 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC188H7C350 402 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FLOT1O75955 427 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GSTA1P08263 222 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LINGO3P0C6S8 592 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM9Q13443 819 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 LAMB3Q13751 1172 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 AOC3Q16853 763 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf91Q3C1V1 193 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 EMC10Q5UCC4 262 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GH2P01242 217 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CREB1P16220 341 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ABL2P42684 1182 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH4Q14624 930 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SETDB1Q15047 1291 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 IKZF4Q9H2S9 585 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEF1Q9HAY2 307 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 STK17AQ9UEE5 414 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 MYH1P12882 1939 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 A0A1W2PRG0 241 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 SNX3O60493 162 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 GFPT2O94808 682 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 RFC5P40937 340 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 BLMHQ13867 455 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 OSGEPQ9NPF4 335 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM120BA0PK00 339 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 F5H6K3 240 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-204ENST00000483092 ASAP2O43150 1006 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms