RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 USP28Q96RU2 1077 aa23.05■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 SLC26A4O43511 780 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 GRIN1Q05586 938 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 MBTD1Q05BQ5 628 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 CALML4Q96GE6 196 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 PLIN2Q99541 437 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 LINC00271P0C7V0 271 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 SKIP12755 728 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 RAB27AP51159 221 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 PPP2R5AQ15172 486 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 ABI1Q8IZP0 508 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 KIFAP3Q92845 792 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 TSPAN1O60635 241 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 LPXNO60711 386 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 EOMESO95936 686 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 NAMPTP43490 491 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 BSNDQ8WZ55 320 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 IFT74Q96LB3 600 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.03■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 AXLP30530 894 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 PPM1EQ8WY54 764 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 CSRNP2Q9H175 543 aa23.02■■□□□ 1.28
NELFE-208ENST00000481121 C2orf40Q9H1Z8 148 aa23.02■■□□□ 1.28
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NELFE-208ENST00000481121 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 C5orf67F2Z3F1 127 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 F13A1P00488 732 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 BMPR1AP36894 532 aa23.01■■□□□ 1.27
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NELFE-208ENST00000481121 RINT1Q6NUQ1 792 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 NOTUMQ6P988 496 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 DEPTORQ8TB45 409 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 RNF19AQ9NV58 838 aa23.01■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 H3BNC9 293 aa23■■□□□ 1.27
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NELFE-208ENST00000481121 STK38Q15208 465 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 AMHR2Q16671 573 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 LRRC43Q8N309 656 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CCDC51Q96ER9 411 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CPB2Q96IY4 423 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 DRC1Q96MC2 740 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 POLD4Q9HCU8 107 aa23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 HIP1RO75146 1068 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G4BP0C869 781 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PLCG1P19174 1290 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 SLC12A3P55017 1021 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PKP1Q13835 747 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 HELQQ8TDG4 1101 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CASD1Q96PB1 797 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 TIPINQ9BVW5 301 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PLVAPQ9BX97 442 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.99■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 ZNF623O75123 536 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 GUCY2CP25092 1073 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 TXLNAP40222 546 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 LONRF3Q496Y0 759 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 SPECC1Q5M775 1068 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 LPPQ93052 612 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 PGBD4Q96DM1 585 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CLIC6Q96NY7 704 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.98■■□□□ 1.27
NELFE-208ENST00000481121 KCND2Q9NZV8 630 aa22.98■■□□□ 1.27
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