RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MAP4K1Q92918 833 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CUL5Q93034 780 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 UBAC1Q9BSL1 405 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KRT23Q9C075 422 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SENP2Q9HC62 589 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SEMA4GQ9NTN9 838 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DNAJB4Q9UDY4 337 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.22□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.21□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ITPR1Q14643 2758 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 SOBPA7XYQ1 873 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 TEX28O15482 410 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 OFD1O75665 1012 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 EFEMP2O95967 443 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CCNE2O96020 404 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 C1QTNF9P0C862 333 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CD72P21854 359 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 FGFR4P22455 802 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CSRP2Q16527 193 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 LPAL2Q16609 132 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PARM1Q6UWI2 310 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.21□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 DDHD2O94830 711 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MYBP10242 640 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PHKA2P46019 1235 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CLCN3P51790 818 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 LIMK1P53667 647 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PDE1AP54750 535 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MTAPQ13126 283 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2SQ16763 222 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 TAS1R1Q7RTX1 841 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 LPPQ93052 612 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 SDF4Q9BRK5 362 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MYL10Q9BUA6 226 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 STK39Q9UEW8 545 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MAST4O15021 2626 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 GLUD1P00367 558 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 C1RP00736 705 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 SOD2P04179 222 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ADH1AP07327 375 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 GPC3P51654 580 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 FAM160B1Q5W0V3 765 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 LILRA6Q6PI73 481 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 METTL13Q8N6R0 699 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 NELL2Q99435 816 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 DSCC1Q9BVC3 393 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF302Q9NR11 478 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 CHST12Q9NRB3 414 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 MARCH5Q9NX47 278 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.19□□□□□ -1.1
CASQ1-203ENST00000481081 DACT1Q9NYF0 836 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms