RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 C12orf42Q96LP6 360 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.57□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC169A6NNP5 214 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF862O60290 1169 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PHACTR2O75167 634 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SOX10P56693 466 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ACBD3Q9H3P7 528 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 INTUQ9ULD6 942 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 RLFQ13129 1914 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 KCNA2P16389 499 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 LMNB1P20700 586 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ADSSP30520 456 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 NPTX2P47972 431 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 OAZ1P54368 228 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 RUBCNQ92622 972 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TAF4BQ92750 862 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 KLRG1Q96E93 195 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ERICH4A6NGS2 130 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SYF2O95926 243 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ADRB2P07550 413 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GLI1P08151 1106 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SP4Q02446 784 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PALB2Q86YC2 1186 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 BSNDQ8WZ55 320 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CEP170P1Q96L14 293 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 OSGEPQ9NPF4 335 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GGA3Q9NZ52 723 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TBX20Q9UMR3 447 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 C19orf81C9J6K1 198 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SORBS3O60504 671 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ABCB4P21439 1286 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 EPC2Q52LR7 807 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 USP38Q8NB14 1042 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 RDM1Q8NG50 284 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 FAM71BQ8TC56 605 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 IWS1Q96ST2 819 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 KRT12Q99456 494 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 MED4Q9NPJ6 270 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PHIPQ8WWQ0 1821 aa14.55□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 MAFGO15525 162 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 STBD1O95210 358 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC172P0C7W6 258 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 RFX1P22670 979 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CETN1Q12798 172 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PRKG1Q13976 671 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 KIF22Q14807 665 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 PEX26Q7Z412 305 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 DAAM2Q86T65 1068 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SAAL1Q96ER3 474 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 DENND3A2RUS2 1198 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CES2O00748 559 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 P4HA2O15460 535 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM253P0C7T8 217 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 TNFAIP3P21580 790 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 CNGA1P29973 690 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 SMTNP53814 917 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.54□□□□□ -0.08
SYCE1-205ENST00000479535 METTL13Q8N6R0 699 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms