RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM150BA6NC51 233 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 PROB1E7EW31 1015 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 HOXA2O43364 376 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 PI15O43692 258 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 STBD1O95210 358 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 EOMESO95936 686 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SRGAP2BP0DMP2 458 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 CIITAP33076 1130 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 PRR16Q569H4 304 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 ABI1Q8IZP0 508 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 VPS52Q8N1B4 723 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 LPPQ93052 612 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SH2D3AQ9BRG2 576 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 NR2E1Q9Y466 385 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 FSD2A1L4K1 749 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 MSH4O15457 936 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 CA8P35219 290 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 PPM1AP35813 382 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 ITIH3Q06033 890 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 CES5AQ6NT32 575 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 UBALD2Q8IYN6 164 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC43Q8N309 656 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 CEP89Q96ST8 783 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 ZBP1Q9H171 429 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 GLT8D2Q9H1C3 349 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 DISC1Q9NRI5 854 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 SAMM50Q9Y512 469 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-208ENST00000479480 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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CTPS1-208ENST00000479480 B4GALT3O60512 393 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTPS1-208ENST00000479480 GALTP07902 379 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CD46P15529 392 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NPR3P17342 541 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TMOD1P28289 359 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NBL1P41271 181 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MTHFRP42898 656 aa9.52□□□□□ -0.89
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CTPS1-208ENST00000479480 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MTMR3Q13615 1198 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KSR1Q8IVT5 923 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PHKBQ93100 1093 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MAP7D2Q96T17 732 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 C6orf50Q9HD87 102 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJB4Q9UDY4 337 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CEP131Q9UPN4 1083 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.52□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ESYT2A0FGR8 921 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PRR23AA6NEV1 266 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 WDR64B1ANS9 1081 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP2AO43633 222 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DDHD2O94830 711 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 CTSAP10619 480 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SLC11A1P49279 550 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 PRKCEQ02156 737 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 NTRK3Q16288 839 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 MTERF2Q49AM1 385 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZUG5 572 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 FRMD5Q7Z6J6 570 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 SLC5A5Q92911 643 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM169Q96HH4 297 aa9.51□□□□□ -0.89
CTPS1-208ENST00000479480 IGSF21Q96ID5 467 aa9.51□□□□□ -0.89
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