RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478044.1

CUL2-208, Transcript of cullin 2, human

TSL 3

Gene CUL2, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUL2-208	ENST00000478044	UBA7	P41226	1012 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DRP2	Q13474	957 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MBTPS1	Q14703	1052 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	GPNMB	Q14956	572 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SLC39A14	Q15043	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PTPA	Q15257	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SHH	Q15465	462 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	IER5	Q5VY09	327 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	USP49	Q70CQ1	688 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ZNF365	Q70YC5	407 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CABP7	Q86V35	215 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	C4orf19	Q8IY42	314 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NEK9	Q8TD19	979 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	EPSTI1	Q96J88	318 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SCLT1	Q96NL6	688 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PANK2	Q9BZ23	570 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CSRNP2	Q9H175	543 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		6.55	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ESPN	B1AK53	854 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044		E9PMD0	336 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SPTLC2	O15270	562 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	LYPLA2	O95372	231 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ME1	P48163	572 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RARRES1	P49788	294 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DNM2	P50570	870 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RAB15	P59190	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	LPIN1	Q14693	890 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	EMC2	Q15006	297 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TCTN1	Q2MV58	587 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TMEM240	Q5SV17	173 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	KCNK18	Q7Z418	384 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RNF135	Q8IUD6	432 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	KSR1	Q8IVT5	923 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NME8	Q8N427	588 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	VWCE	Q96DN2	955 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CEP89	Q96ST8	783 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MAP7D2	Q96T17	732 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	OSMR	Q99650	979 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	DNM3	Q9UQ16	869 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	COL1A2	P08123	1366 aa		6.54	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044		A0A087WZ62	844 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	FGFR4	P22455	802 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	CD52	P31358	61 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RFC2	P35250	354 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	NUCB2	P80303	420 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RBL2	Q08999	1139 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	MGAT3	Q09327	533 aa		6.53	□□□□□ -1.36
CUL2-208	ENST00000478044	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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