RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477671.2

DNAJB4-204, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B4, human

TSL 5

Gene DNAJB4, Length 737 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNAJB4-204	ENST00000477671	TNKS	O95271	1327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	KATNA1	O75449	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CNMD	O75829	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CABYR	O75952	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	REC8	O95072	547 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	IGHD	P01880	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ICAM1	P05362	532 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CYBA	P13498	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	GUCY2F	P51841	1108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	TNP2	Q05952	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	BIRC2	Q13490	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	DBN1	Q16643	649 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SV2C	Q496J9	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	MAP9	Q49MG5	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CD163	Q86VB7	1156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	NINJ1	Q92982	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	MFSD3	Q96ES6	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CDC6	Q99741	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.55	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671		B4E1Z4	1266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SGSM2	O43147	1006 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	KPNA6	O60684	536 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	PDHB	P11177	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ALAS1	P13196	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CPB1	P15086	417 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CHML	P26374	656 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	MCM5	P33992	734 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CCNF	P41002	786 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CPT1A	P50416	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	HAND2	P61296	217 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ZNF543	Q08ER8	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	INPP5A	Q14642	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	WTAP	Q15007	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
DNAJB4-204	ENST00000477671	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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