RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 UBA7P41226 1012 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NAMPTP43490 491 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FAM187BQ17R55 369 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NAALADL2Q58DX5 795 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 UBXN11Q5T124 520 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 RSPH1Q8WYR4 309 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 KIFAP3Q92845 792 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CASD1Q96PB1 797 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PLVAPQ9BX97 442 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CCSER1Q9C0I3 900 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FZD8Q9H461 694 aa18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NLRC5Q86WI3 1866 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TSPAN1O60635 241 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FGFR1P11362 822 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 IGFBP4P22692 258 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 GATMP50440 423 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 RAB27AP51159 221 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 SLC12A3P55017 1021 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 BSNDQ8WZ55 320 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 P2RX5Q93086 422 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TIPINQ9BVW5 301 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 FAM105AQ9NUU6 356 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 KCND2Q9NZV8 630 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MTUS1Q9ULD2 1270 aa18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1B0GUA9 196 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 GUCY2CP25092 1073 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PPP2R5AQ15172 486 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 DAW1Q8N136 415 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC51Q96ER9 411 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CALML4Q96GE6 196 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 RUSC1Q9BVN2 902 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CSRNP2Q9H175 543 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CWH43Q9H720 699 aa18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ERLIN2O94905 339 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 F13A1P00488 732 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MAPK7Q13164 816 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 GPM6BQ13491 265 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC55Q6ZSA7 311 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CNNM3Q8NE01 707 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC15Q8TF66 581 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PLIN2Q99541 437 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 POLD4Q9HCU8 107 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa18.22■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 REV3LO60673 3130 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G4BP0C869 781 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PKP1Q13835 747 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ARSHQ5FYA8 562 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ATL3Q6DD88 541 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 NOTUMQ6P988 496 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 USP49Q70CQ1 688 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 GDPD5Q8WTR4 605 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PGBD4Q96DM1 585 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 EPSTI1Q96J88 318 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 IFT74Q96LB3 600 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa18.21■□□□□ 0.51
ATG4B-216ENST00000475195 MYH15Q9Y2K3 1946 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 ACKR2O00590 384 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 HIP1RO75146 1068 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 PPP6R2O75170 966 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 OFD1O75665 1012 aa18.2■□□□□ 0.5
ATG4B-216ENST00000475195 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms