RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471724.5

SSR4-207, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-207ENST00000471724 RPS6KA5O75582 802 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ERLIN2O94905 339 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CXCL10P02778 98 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CSF2RAP15509 400 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MCM4P33991 863 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NPTX2P47972 431 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 LPIN1Q14693 890 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MBTPS1Q14703 1052 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 UNC13DQ70J99 1090 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MYCT1Q8N699 235 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 IFT122Q9HBG6 1241 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 IL23AQ9NPF7 189 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PANK4Q9NVE7 773 aa15.5■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 K7ENM7 598 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 TRAK2O60296 914 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NBNO60934 754 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ACTN1P12814 892 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NCKAP1LP55160 1127 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 COASYQ13057 564 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ALCAMQ13740 583 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SFR1Q86XK3 245 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 TMEM40Q8WWA1 233 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SEPT8Q92599 483 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PRIMPOLQ96LW4 560 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 EXOC1Q9NV70 894 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.49■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SFI1A8K8P3 1242 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MBTD1Q05BQ5 628 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CUL4BQ13620 913 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MAPK6Q16659 721 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FAM228AQ86W67 206 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 KCNN1Q92952 543 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 HVCN1Q96D96 273 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SLC16A4O15374 487 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 EFCAB14O75071 495 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 BAIAP3O94812 1187 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SMC2O95347 1197 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PRR29P0C7W0 189 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CD52P31358 61 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 DPYDQ12882 1025 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 STRN3Q13033 797 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FAM187BQ17R55 369 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 FAM26FQ5R3K3 315 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 KIFC3Q9BVG8 833 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 POLD4Q9HCU8 107 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 RMND1Q9NWS8 449 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PADI3Q9ULW8 664 aa15.47■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 UBE4BO95155 1302 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 K7ERI5 159 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SLC34A2O95436 690 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 RPN1P04843 607 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 PRKCBP05771 671 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CASP1P29466 404 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 AXLP30530 894 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 GPNMBQ14956 572 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 DBF4BQ8NFT6 615 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 SMARCE1Q969G3 411 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 CCDC51Q96ER9 411 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.46■□□□□ 0.07
SSR4-207ENST00000471724 MINDY3Q9H8M7 445 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms