RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466278.1

MKL1-208, Transcript of MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MKL1, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1-208ENST00000466278 MINDY3Q9H8M7 445 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 FAM105AQ9NUU6 356 aa25.38■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 IRS1P35568 1242 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PPM1AP35813 382 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 CTC1Q2NKJ3 1217 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 CATSPER3Q86XQ3 398 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ZNF558Q96NG5 402 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 TLR9Q9NR96 1032 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 BDP1A6H8Y1 2624 aa25.37■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 H3BQ06 376 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ZNF623O75123 536 aa25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MED24O75448 989 aa25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 HAUS3Q68CZ6 603 aa25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 KCNT2Q6UVM3 1135 aa25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 LZTS1Q9Y250 596 aa25.36■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 USO1O60763 962 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ERLIN2O94905 339 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 RPA1P27694 616 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PTENP60484 403 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PLCB3Q01970 1234 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 POU5F1BQ06416 359 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 NBR1Q14596 966 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PGBD4Q96DM1 585 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 NACC1Q96RE7 527 aa25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MUTP22033 750 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ARL2P36404 184 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 CAPSQ13938 189 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 POTEGQ6S5H5 508 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 GLB1LQ6UWU2 654 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 LPPQ93052 612 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 IGFLR1Q9H665 355 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 FAM50BQ9Y247 325 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa25.34■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 GJB2P29033 226 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 AXLP30530 894 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 LTBRP36941 435 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MCTP1Q6DN14 999 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MCPH1Q8NEM0 835 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 NFKBIZQ9BYH8 718 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 SPG21Q9NZD8 308 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.33■■□□□ 1.65
MKL1-208ENST00000466278 A0A087WWV3 80 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 CARNS1A5YM72 827 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 GRXCR2A6NFK2 248 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 LAD1O00515 517 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 GLRA2P23416 452 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 PBX3P40426 434 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 KRT17Q04695 432 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 CCDC51Q96ER9 411 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 RAB34Q9BZG1 259 aa25.32■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 FSD2A1L4K1 749 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 H3BQV1 296 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 TSPAN1O60635 241 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 TBX10O75333 385 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 IL9P15248 144 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 NRIP1P48552 1158 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.31■■□□□ 1.64
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MKL1-208ENST00000466278 ADAM15Q13444 863 aa25.31■■□□□ 1.64
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MKL1-208ENST00000466278 NOMO2Q5JPE7 1267 aa25.31■■□□□ 1.64
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MKL1-208ENST00000466278 SLC39A11Q8N1S5 342 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 EFHBQ8N7U6 833 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 STK24Q9Y6E0 443 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.31■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 ARHGEF35A5YM69 484 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 MEIS3P2A8K0S8 358 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 FSCN2O14926 492 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 LINC01565O15544 149 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 NDUFV1P49821 464 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 BCAR1P56945 870 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 ERVFC1P60507 584 aa25.3■■□□□ 1.64
MKL1-208ENST00000466278 PDIA5Q14554 519 aa25.3■■□□□ 1.64
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