RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 GGPS1O95749 300 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GZMAP12544 262 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TNFAIP3P21580 790 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NF2P35240 595 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CAP2P40123 477 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 JAK3P52333 1124 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SLC20A2Q08357 652 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BIRC3Q13489 604 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KIF22Q14807 665 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ODR4Q5SWX8 454 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 C3orf20Q8ND61 904 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DYDC2Q96IM9 177 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RAB17Q9H0T7 212 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CARD9Q9H257 536 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SUGCTQ9HAC7 445 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SIX2Q9NPC8 291 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PGAP2Q9UHJ9 254 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NCANO14594 1321 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RPTORQ8N122 1335 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.24□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM187AA6NFU0 413 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 F8VZ95 297 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 AGPSO00116 658 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EML1O00423 815 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KCNK3O14649 394 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KIF3CO14782 793 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.931e-14■□□□□ 9.6
ACTB-208ENST00000464611 EXOC3O60645 756 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R37O75864 691 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GTF2H1P32780 548 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 QARSP47897 775 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CASP5P51878 434 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SMTNP53814 917 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CACNB3P54284 484 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CYP4A11Q02928 519 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ARID5AQ03989 594 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BFSP1Q12934 665 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MIER3Q7Z3K6 550 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 C4orf19Q8IY42 314 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HES6Q96HZ4 224 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PLVAPQ9BX97 442 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RGL1Q9NZL6 768 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PARP2Q9UGN5 583 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GGA2Q9UJY4 613 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CNTNAP1P78357 1384 aa9.23□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CEP104O60308 925 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EVI5O60447 810 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 STAM2O75886 525 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MTA2O94776 668 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TOMM70O94826 608 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PLS3P13797 630 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CXCR5P32302 372 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GTF2BQ00403 316 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MYL7Q01449 175 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KRT76Q01546 638 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 GUCY2DQ02846 1103 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DCAF15Q66K64 600 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PADI6Q6TGC4 694 aa9.22□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.22□□□□□ -0.93
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