RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 MOB2Q70IA6 237 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RABGGTAQ92696 567 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ACCSQ96QU6 501 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ZHX3Q9H4I2 956 aa6.18□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087X0T9 212 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 K7ENM7 598 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 GRIN3BO60391 1043 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 LGR5O75473 907 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GFPT2O94808 682 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 PSAPP07602 524 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 FAM228BP0C875 321 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 XKR3Q5GH77 459 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC122Q5T0U0 273 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 HS2ST1Q7LGA3 356 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 SULF1Q8IWU6 871 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 KIFAP3Q92845 792 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-210ENST00000462363 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM206Q9H813 350 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 ELP3Q9H9T3 547 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 RAB21Q9UL25 225 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-210ENST00000462363 TBX20Q9UMR3 447 aa6.17□□□□□ -1.42
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