RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 MFSD5Q6N075 450 aa21.56■■□□□ 1.04
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SNHG12-201ENST00000461448 TMEM199Q8N511 208 aa21.56■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 IFT122Q9HBG6 1241 aa21.56■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 OLFML3Q9NRN5 406 aa21.56■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.56■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 SLC16A4O15374 487 aa21.55■■□□□ 1.04
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SNHG12-201ENST00000461448 PTENP60484 403 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 POU5F1BQ06416 359 aa21.55■■□□□ 1.04
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SNHG12-201ENST00000461448 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 FAM178BQ8IXR5 827 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM40Q8WWA1 233 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 OSBPL7Q9BZF2 842 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 LPIN1Q14693 890 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa21.55■■□□□ 1.04
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SNHG12-201ENST00000461448 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
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SNHG12-201ENST00000461448 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NBNO60934 754 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 RPS6KA5O75582 802 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 KIF20AO95235 890 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 FGFR4P22455 802 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 ALCAMQ13740 583 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.54■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 K7ENM7 598 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 CSF2RAP15509 400 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 RFC2P35250 354 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 EHHADHQ08426 723 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 USP38Q8NB14 1042 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 HPS3Q969F9 1004 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NFKBIZQ9BYH8 718 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 SQORQ9Y6N5 450 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 MYH11P35749 1972 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 CD52P31358 61 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 PPP1R2P41236 205 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 EFNA5P52803 228 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NCKAP1LP55160 1127 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 PAK2Q13177 524 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 GPNMBQ14956 572 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 CATSPER4Q7RTX7 472 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa21.52■■□□□ 1.04
SNHG12-201ENST00000461448 DENND3A2RUS2 1198 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 K7ERI5 159 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 MBTD1Q05BQ5 628 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 MORC3Q14149 939 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 FAM228AQ86W67 206 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 FIZ1Q96SL8 496 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 PADI3Q9ULW8 664 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 GPR182O15218 404 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 GCNT3O95395 438 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 FPGSQ05932 587 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 STIM1Q13586 685 aa21.51■■□□□ 1.03
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SNHG12-201ENST00000461448 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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SNHG12-201ENST00000461448 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 DACH1Q9UI36 760 aa21.51■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 BIN1O00499 593 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 ERLIN2O94905 339 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 CXCL10P02778 98 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 PRKCBP05771 671 aa21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.034e-7■■■□□ 16.5
SNHG12-201ENST00000461448 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SNHG12-201ENST00000461448 KCNN1Q92952 543 aa21.5■■□□□ 1.03
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