RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460909.1

RPUSD3-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF576Q9H609 170 aa22.82■■□□□ 1.24
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RPUSD3-210ENST00000460909 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 TXLNAP40222 546 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 NAMPTP43490 491 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 NUCB2P80303 420 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 TAP1Q03518 808 aa22.81■■□□□ 1.24
RPUSD3-210ENST00000460909 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
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RPUSD3-210ENST00000460909 ZNF131P52739 623 aa22.76■■□□□ 1.23
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RPUSD3-210ENST00000460909 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.76■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 A0A1B0GUA9 196 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 CCDC169A6NNP5 214 aa22.75■■□□□ 1.23
RPUSD3-210ENST00000460909 EOMESO95936 686 aa22.75■■□□□ 1.23
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