RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458938.2

U3.44-201, humanhuman

BASIC

Gene U3, Length 192 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3.44-201ENST00000458938 SPECC1Q5M775 1068 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GPR153Q6NV75 609 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 FAM173BQ6P4H8 233 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 B3GNT9Q6UX72 402 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NIPA1Q7RTP0 329 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NOSTRINQ8IVI9 506 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TNS4Q8IZW8 715 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SCFD2Q8WU76 684 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MAML1Q92585 1016 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GJA10Q969M2 543 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ITFG2Q969R8 447 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MTMR9Q96QG7 549 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SPAG5Q96R06 1193 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 UIMC1Q96RL1 719 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 LUZP4Q9P127 313 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CNTN3Q9P232 1028 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 Q9Y3F1 56 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 HTTP42858 3142 aa4□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GRIN2DO15399 1336 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ZBBXA8MT70 800 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SMTNL1A8MU46 457 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 FAM25EA8MYX2 175 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SLC37A4O43826 429 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 RFPL1O75677 317 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PSMD10O75832 226 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GGPS1O95749 300 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CCNE2O96020 404 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TFRCP02786 760 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 AKR1A1P14550 325 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CD46P15529 392 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TYRP1P17643 537 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NDUFV2P19404 249 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TSPAN7P41732 249 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 HALP42357 657 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TRPC1P48995 793 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NEK2P51955 445 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 BEX3Q00994 111 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SLC20A2Q08357 652 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SPIRE1Q08AE8 756 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 RESTQ13127 1097 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PAK2Q13177 524 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MTMR1Q13613 665 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 LAMC2Q13753 1193 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NEDD9Q14511 834 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 DSC3Q14574 896 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 TTLL4Q14679 1199 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 LRRC41Q15345 812 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PTPN14Q15678 1187 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ZNF174Q15697 407 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 KCNA10Q16322 511 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 QPCTQ16769 361 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 LETM2Q2VYF4 491 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 HSDL1Q3SXM5 330 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 FILIP1LQ4L180 1135 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 GNASQ5JWF2 1037 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 FAM102BQ5T8I3 360 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MCTP1Q6DN14 999 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SWSAP1Q6NVH7 229 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 KCNV1Q6PIU1 500 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MOXD1Q6UVY6 613 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ABHD15Q6UXT9 468 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CYFIP1Q7L576 1253 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NEK8Q86SG6 692 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NLRX1Q86UT6 975 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PLPP6Q8IY26 295 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 PGBD3Q8N328 593 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 NAXEQ8NCW5 288 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 AFG1LQ8WV93 481 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 KAT2BQ92831 832 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 SLC5A5Q92911 643 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 HIC2Q96JB3 615 aa3.99□□□□□ -1.77
U3.44-201ENST00000458938 CHAMP1Q96JM3 812 aa3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms