RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KCTD1Q719H9 257 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLF2Q8IX21 1173 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SEC14L1Q92503 715 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 C15orf41Q9Y2V0 281 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ASAP2O43150 1006 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KRT16P08779 473 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RARAP10276 462 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NCALDP61601 193 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ERICH1Q86X53 443 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ADGRF4Q8IZF3 695 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF570Q96NI8 536 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 REEP2Q9BRK0 252 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 COG5Q9UP83 839 aa16.66■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GCNT3O95395 438 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ACSL3O95573 720 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 STAT1P42224 750 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NFIAQ12857 509 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 PLS1Q14651 629 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TNIP1Q15025 636 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SEPT14Q6ZU15 432 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RDH13Q8NBN7 331 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 P3H4Q92791 437 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 USP17L10C9JJH3 530 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NR3C1P04150 777 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SNAP25P60880 206 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 TTC27Q6P3X3 843 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CENPTQ96BT3 561 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KLHL29Q96CT2 875 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 JMJD4Q9H9V9 463 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 KIF9Q9HAQ2 790 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 RASGRF2O14827 1237 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 POLD1P28340 1107 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 GIT2Q14161 759 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC17A8Q8NDX2 589 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 SLC35C1Q96A29 364 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 NT5C3AQ9H0P0 336 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.65■□□□□ 0.26
SFRP4-201ENST00000436072 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ENO4A6NNW6 628 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MYBL1P10243 752 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CNGA2Q16280 664 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FRMD5Q7Z6J6 570 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 EBF2Q9HAK2 575 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GAKO14976 1311 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM49P0CI25 452 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM49CP0CI26 452 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PRKCIP41743 596 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 MAPK7Q13164 816 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ITIH4Q14624 930 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 COG2Q14746 738 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PGM2Q96G03 612 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 COA1Q9GZY4 146 aa16.64■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ESYT2A0FGR8 921 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SNX3O60493 162 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 GH1P01241 217 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SLC12A3P55017 1021 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 JAM2P57087 298 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 SEPT2Q15019 361 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 EXOC3L1Q86VI1 746 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 HOOK2Q96ED9 719 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 NUDT17P0C025 328 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 TNFAIP3P21580 790 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 PRR16Q569H4 304 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 C6orf118Q5T5N4 469 aa16.63■□□□□ 0.25
SFRP4-201ENST00000436072 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms