RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 FBXL18Q96ME1 805 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 APOL5Q9BWW9 433 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.72■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PFKFB2O60825 505 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CXCL14O95715 111 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NPEPPSP55786 919 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 CES5AQ6NT32 575 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 WASF1Q92558 559 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 LPPQ93052 612 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 PBXIP1Q96AQ6 731 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.71■■□□□ 1.23
ELL3-202ENST00000433927 RFC5P40937 340 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ITIH3Q06033 890 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 GIT2Q14161 759 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 EPHA7Q15375 998 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 LONRF3Q496Y0 759 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 OTUD6AQ7L8S5 288 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 C4orf19Q8IY42 314 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 VPS52Q8N1B4 723 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NR2E1Q9Y466 385 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 PIEZO1Q92508 2521 aa22.7■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD1Q15327 319 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TCP11Q8WWU5 503 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 LXNQ9BS40 222 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 WDFY4Q6ZS81 3184 aa22.69■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ASAP2O43150 1006 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 OFD1O75665 1012 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 GALTP07902 379 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 YWHABP31946 246 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NHLH1Q02575 133 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 URGCPQ8TCY9 931 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 OXER1Q8TDS5 423 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 HAS1Q92839 578 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TMEM143Q96AN5 459 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 IGSF21Q96ID5 467 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ZBP1Q9H171 429 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.68■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 CTSAP10619 480 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ANAPC15P60006 121 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 PTPN21Q16825 1174 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ZBTB33Q86T24 672 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 POTEDQ86YR6 584 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 STK39Q9UEW8 545 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 IRAK3Q9Y616 596 aa22.67■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 NEFLP07196 543 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 KRT2P35908 639 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 MTHFRP42898 656 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 PRRX2Q99811 253 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 GBP3Q9H0R5 595 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 RGL1Q9NZL6 768 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.66■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 EMC2Q15006 297 aa22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 XKR9Q5GH70 373 aa22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 FBXL6Q8N531 539 aa22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 DYDC2Q96IM9 177 aa22.65■■□□□ 1.22
ELL3-202ENST00000433927 CTDNEP1O95476 244 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms