RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 NR5A1Q13285 461 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 CATSPER4Q7RTX7 472 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 KSR1Q8IVT5 923 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 TCP11Q8WWU5 503 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.47■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 HIDE1A8MVS5 230 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 MARCH6O60337 910 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 BCAR1P56945 870 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 TRIOO75962 3097 aa23.46■■□□□ 1.35
LIMS1-208ENST00000428064 ASAP2O43150 1006 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 LARGE1O95461 756 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD54Q6NXT1 300 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TMC7Q7Z402 723 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NECAB1Q8N987 351 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 PGBD4Q96DM1 585 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 S1PR5Q9H228 398 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 RGL1Q9NZL6 768 aa23.45■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 FAM205CA6NFA0 338 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 LYPLA2O95372 231 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 EMC2Q15006 297 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM169Q96HH4 297 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 DYDC2Q96IM9 177 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.44■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 C2orf71A6NGG8 1288 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 DTNBO60941 627 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 SLITRK3O94933 977 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 FERMT3Q86UX7 667 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CASP10Q92851 521 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 LPPQ93052 612 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM143Q96AN5 459 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 KCNH6Q9H252 994 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 IRAK3Q9Y616 596 aa23.43■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 OFD1O75665 1012 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TECP42680 631 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 GIT2Q14161 759 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 XKR9Q5GH70 373 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 SYCE2Q6PIF2 218 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 EDAQ92838 391 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MTRQ99707 1265 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 ZBP1Q9H171 429 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 STK39Q9UEW8 545 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.42■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CYP4A11Q02928 519 aa23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 POU5F1BQ06416 359 aa23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CALCRLQ16602 461 aa23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 IGSF21Q96ID5 467 aa23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 BTBD18B2RXH4 712 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NEMFO60524 1076 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 GALTP07902 379 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 NEK4P51957 841 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM29Q14134 588 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 TPH2Q8IWU9 490 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 RNF149Q8NC42 400 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 CNNM3Q8NE01 707 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 URGCPQ8TCY9 931 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.4■■□□□ 1.34
LIMS1-208ENST00000428064 DGAT1O75907 488 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 CTSAP10619 480 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 AXLP30530 894 aa23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
LIMS1-208ENST00000428064 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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