RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PYGM	P11217	842 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CA8	P35219	290 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CASP7	P55210	303 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF174	Q15697	407 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GDAP1	Q8TB36	358 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KRT82	Q9NSB4	513 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PASK	Q96RG2	1323 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASMTL	O95671	621 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYH6	P13533	1939 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AP1B1	Q10567	949 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKN1	Q16512	942 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PROM2	Q8N271	834 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		11.25	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM120B	A0PK00	339 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CES2	O00748	559 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSMA7	O14818	248 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAP3K7	O43318	606 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IFNAR1	P17181	557 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MARK3	P27448	753 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USH1G	Q495M9	461 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM50	Q86XT4	487 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CUEDC2	Q9H467	287 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHKB	Q9Y259	395 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR6B1	O95007	311 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CBX6	O95503	412 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACVR2B	Q13705	512 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAP1	Q92560	729 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.24	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658		B4E1Z4	1266 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GH1	P01241	217 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PSMD7	P51665	324 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MTTP	P55157	894 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HDAC4	P56524	1084 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KCNQ4	P56696	695 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXNRD1	Q16881	649 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DAAM2	Q86T65	1068 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.23	□□□□□ -0.61

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