RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427506.5

GPC1-205, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPC1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-205ENST00000427506 MCM2P49736 904 aa20.5■□□□□ 0.87
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GPC1-205ENST00000427506 LPPQ93052 612 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-205ENST00000427506 PGBD4Q96DM1 585 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-205ENST00000427506 NACC1Q96RE7 527 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-205ENST00000427506 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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GPC1-205ENST00000427506 TLR9Q9NR96 1032 aa20.5■□□□□ 0.87
GPC1-205ENST00000427506 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GPC1-205ENST00000427506 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
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GPC1-205ENST00000427506 COL19A1Q14993 1142 aa20.49■□□□□ 0.87
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GPC1-205ENST00000427506 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.46■□□□□ 0.87
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GPC1-205ENST00000427506 TCF25Q9BQ70 676 aa20.45■□□□□ 0.86
GPC1-205ENST00000427506 GBP3Q9H0R5 595 aa20.45■□□□□ 0.86
GPC1-205ENST00000427506 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.45■□□□□ 0.86
GPC1-205ENST00000427506 STK24Q9Y6E0 443 aa20.45■□□□□ 0.86
GPC1-205ENST00000427506 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
GPC1-205ENST00000427506 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa20.45■□□□□ 0.86
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