RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 CCNYL1Q8N7R7 359 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PPM1NQ8N819 430 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 MCPH1Q8NEM0 835 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP8B3O60423 1300 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 BNIP3LO60238 219 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HEY1Q9Y5J3 304 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ARFIP2P53365 341 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 ARPP19P56211 112 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNH2Q12809 1159 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RASGRF1Q13972 1273 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NLRP10Q86W26 655 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 CREB3O43889 395 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 NR3C1P04150 777 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PDHA1P08559 390 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GCLMP48507 274 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 PMS2P54278 862 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 COPS2P61201 443 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 AP3B2Q13367 1082 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 GTSE1Q9NYZ3 720 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM33Q9UPN9 1127 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC8A2Q9UPR5 921 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RABGAP1LQ5R372 815 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PIGOQ8TEQ8 1089 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC6O95255 1503 aa11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CLDN3O15551 220 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ATXN8OSP0DMR3 200 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNA3P32297 505 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK8P49336 464 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM161BQ96MY7 647 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DIAPH2O60879 1101 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CASP1P29466 404 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SFR1Q86XK3 245 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SEPT8Q92599 483 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3GLB2Q9NR46 395 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NDE1Q9NXR1 346 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 BFARQ9NZS9 450 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CALB1P05937 261 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ANXA13P27216 316 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCA1P28370 1054 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PRCPP42785 496 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ULK4Q96C45 1275 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM167BQ9BTA0 163 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP26B1Q9NR63 512 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CFAP73A6NFT4 308 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 POTEMA6NI47 508 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 AP2B1P63010 937 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DAB2P98082 770 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 C16orf87Q6PH81 154 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RMDN2Q96LZ7 410 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC26A0AVF1 554 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB2P05120 415 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ELF1P32519 619 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MAPK6Q16659 721 aa11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms