RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB27AP51159 221 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCT2P78371 535 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIT2Q14161 759 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF21Q96ID5 467 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D13Q9NVG8 400 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.8□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO10Q9HD67 2058 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPCAMP16422 314 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LONRF3Q496Y0 759 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.79□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEIS3P2A8K0S8 358 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0Y858 1186 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASGR2P07307 311 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALTP07902 379 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP3A7P24462 503 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMA5P28066 241 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVCP57679 992 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KANK3Q6NY19 840 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP4Q96MN2 994 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBOAT7Q96N66 472 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USTQ9Y2C2 406 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP54Q96N23 3096 aa14.78□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0R2N6 131 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF623O75123 536 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OFD1O75665 1012 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC11A1P49279 550 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN14Q15678 1187 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G4FQ68DD2 849 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANO5Q75V66 913 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KSR1Q8IVT5 923 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBP3Q9H0R5 595 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.77□□□□□ -0.04
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.77□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B4GALT3O60512 393 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEXIO95424 95 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMC5P62195 406 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABP7Q86V35 215 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLIDQ8IZY5 108 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGBD4Q96DM1 585 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFT122Q9HBG6 1241 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPY5RQ15761 445 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF280BQ86YH2 543 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FEZF2Q8TBJ5 459 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URGCPQ8TCY9 931 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX27Q96L92 541 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK39Q9UEW8 545 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa14.76□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID2Q68CP9 1835 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROB1E7EW31 1015 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EML1O00423 815 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC37A4O43826 429 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT17Q6IS24 598 aa14.75□□□□□ -0.05
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms