RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, human

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAAP20-208	ENST00000420964	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KBTBD13	C9JR72	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ASAP2	O43150	1006 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CYP2C9	P11712	490 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ADAM17	P78536	824 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SESTD1	Q86VW0	696 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	RNF149	Q8NC42	400 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNN1	Q92952	543 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NLRP4	Q96MN2	994 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TBX20	Q9UMR3	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.55	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A1W2PQY0	241 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	DNM1L	O00429	736 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PDXK	O00764	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TREH	O43280	583 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	VTN	P04004	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF18	P17022	549 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	EFNA5	P52803	228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GBP3	Q9H0R5	595 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	THAP9	Q9H5L6	903 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		13.54	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NR3C1	P04150	777 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ATP1A3	P13637	1013 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PHKA2	P46019	1235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	STRN3	Q13033	797 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ITGA7	Q13683	1181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	BICD1	Q96G01	975 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	GRIN2D	O15399	1336 aa		13.53	□□□□□ -0.24
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964		K7ERI5	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NR2F2	P24468	414 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	GPC3	P51654	580 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PTEN	P60484	403 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NFIL3	Q16649	462 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CEP63	Q96MT8	703 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A087WZ62	844 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	TISP43	B9A030	160 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CETN3	O15182	167 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	CLIC2	O15247	247 aa		13.51	□□□□□ -0.25
FAAP20-208	ENST00000420964	AP5Z1	O43299	807 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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