RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 ACVR2BQ13705 512 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 IFT74Q96LB3 600 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.93■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 CCP110O43303 1012 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 HOXC6P09630 235 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 SMPD1P17405 629 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 APBA1Q02410 837 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 CYP26C1Q6V0L0 522 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 PPTC7Q8NI37 304 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 DESI2Q9BSY9 194 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 EXOC7Q9UPT5 735 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ADCY6O43306 1168 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 CNGA1P29973 690 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 NAMPTP43490 491 aa22.92■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 PPP2R5AQ15172 486 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 XXYLT1Q8NBI6 393 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 NEK11Q8NG66 645 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 AFG1LQ8WV93 481 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 GANQ9H2C0 597 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.91■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 LGALS2P05162 132 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 RDH13Q8NBN7 331 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 GJD2Q9UKL4 321 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.9■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 IGHA2P01877 340 aa22.89■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 SLC9A1P19634 815 aa22.89■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 BFSP1Q12934 665 aa22.89■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.89■■□□□ 1.26
GPC1-202ENST00000420138 H0YCG3 227 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 MAPK13O15264 365 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PON1P27169 355 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CTGFP29279 349 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CAPSQ13938 189 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PLEKHO2Q8TD55 490 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CEP72Q9P209 647 aa22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 LRRC53A6NM62 1247 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 HBP1O60381 514 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 TUBB4AP04350 444 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 TRIM49P0CI25 452 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 TRIM49CP0CI26 452 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CDK17Q00537 523 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CBWD6Q4V339 395 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CBWD3Q5JTY5 395 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CBWD5Q5RIA9 395 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 SIX2Q9NPC8 291 aa22.88■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ZSCAN12O43309 604 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ADRB2P07550 413 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ACTN1P12814 892 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ABCD1P33897 745 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 FMO5P49326 533 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 DLG4P78352 724 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 HTRA3P83110 453 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 CCL14Q16627 93 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 IER5Q5VY09 327 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PDXDC1Q6P996 788 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 ZNF592Q92610 1267 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 FBXL18Q96ME1 805 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 TRPC6Q9Y210 931 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 LRRIQ4A6NIV6 560 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 PPFIA4O75335 1185 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 EDN1P05305 212 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 SCP2P22307 547 aa22.87■■□□□ 1.25
GPC1-202ENST00000420138 MAP2K2P36507 400 aa22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms