RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 SOX5P35711 763 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 STX1BP61266 288 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR91A4D1P6 747 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 ARL4CP56559 192 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 RFFLQ8WZ73 363 aa22.86■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 STAT5BP51692 787 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 STK4Q13043 487 aa22.85■■□□□ 1.25
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PTPRJ-201ENST00000418331 GBP5Q96PP8 586 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 REEP2Q9BRK0 252 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 VCPKMTQ9H867 229 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PTPRJ-201ENST00000418331 CSPG5O95196 566 aa22.83■■□□□ 1.25
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