RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412845.1

NEFHP1-201, Transcript of neurofilament heavy pseudogene 1, humanhuman

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Gene NEFHP1, Length 2,629 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP1-201ENST00000412845 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.3■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.3■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 MSH4O15457 936 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PHF2O75151 1096 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CLTAP09496 248 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 SLC8A1P32418 973 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CYP2J2P51589 502 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 TLDC1Q6P9B6 456 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CNBD1Q8NA66 436 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 VAV3Q9UKW4 847 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CEP83Q9Y592 693 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ANKRD62A6NC57 917 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP2B4P23634 1241 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 MYCT1Q8N699 235 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 RASAL2Q9UJF2 1139 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.29■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM196BA6NMK8 535 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 AGTP01019 485 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 USH1GQ495M9 461 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 Q4G0T1 1027 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 MIEF2Q96C03 454 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 OLFML3Q9NRN5 406 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 EYA4O95677 639 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 C6orf118Q5T5N4 469 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 BARGINQ6ZT62 677 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 USP40Q9NVE5 1235 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 APEX2Q9UBZ4 518 aa20.28■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 RIPK2O43353 540 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 GSTA1P08263 222 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 ADCY2Q08462 1091 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 AUHQ13825 339 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 LRRC14Q15048 493 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CNGA2Q16280 664 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 TBX3O15119 743 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM13AO94988 1023 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 PSEN1P49768 467 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 AP3B2Q13367 1082 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.27■□□□□ 0.84
NEFHP1-201ENST00000412845 AFF2P51816 1311 aa20.27■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CHRNA3P32297 505 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RDH13Q8NBN7 331 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 RASGRF2O14827 1237 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 UBOX5O94941 541 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CREB1P16220 341 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CTNNA2P26232 953 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNJ1P48048 391 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 KCNJ2P63252 427 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MGARPQ8TDB4 240 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 AGPAT1Q99943 283 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ZSWIM1Q9BR11 485 aa20.26■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 C6orf229H3BNL8 230 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FTLP02792 175 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MMP14P50281 582 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 SCNN1DP51172 638 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 MYL7Q01449 175 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 KIF22Q14807 665 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 EXOC3L1Q86VI1 746 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CCDC25Q86WR0 208 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 CERS5Q8N5B7 392 aa20.25■□□□□ 0.83
NEFHP1-201ENST00000412845 FAM20AQ96MK3 541 aa20.25■□□□□ 0.83
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