RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CNGA1P29973 690 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 CST9Q5W186 159 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC35F6Q8N357 371 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ASAP3Q8TDY4 903 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 JAKMIP2Q96AA8 810 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 AIPL1Q9NZN9 384 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GJB7Q6PEY0 223 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 LGR5O75473 907 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 VAMP7P51809 220 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SPA17Q15506 151 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ASIC2Q16515 512 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM50Q86XT4 487 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA33Q96N06 139 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 LACRTQ9GZZ8 138 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 AZI2Q9H6S1 392 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MAPK13O15264 365 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 AKR1B10O60218 316 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ADRB2P07550 413 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GLRA2P23416 452 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ARL2P36404 184 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 RFC5P40937 340 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 VAV2P52735 878 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MYL7Q01449 175 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC7A3Q8WY07 619 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SAAL1Q96ER3 474 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 MARK3P27448 753 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 ARID5AQ03989 594 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL4Q14679 1199 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf220Q5T0J3 134 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 IQCEQ6IPM2 695 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GLG1Q92896 1179 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 SPAG5Q96R06 1193 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 EMSYQ7Z589 1322 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP5-204ENST00000412806 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP3CAQ08209 521 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 CBWD2Q8IUF1 395 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 H0YCG3 227 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 JAM2P57087 298 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRN4CLQ8ND94 238 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 SCFD2Q8WU76 684 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM167AQ96KS9 214 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO6Q9UM54 1294 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT86O43790 486 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 STRNO43815 780 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 NAMPTP43490 491 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 KLHL30Q0D2K2 578 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 GPR142Q7Z601 462 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 POMGNT1Q8WZA1 660 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 BICD1Q96G01 975 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 ERO1AQ96HE7 468 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRIQ4A6NIV6 560 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 HUNKP57058 714 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 PLCB4Q15147 1175 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP5-204ENST00000412806 LMO3Q8TAP4 145 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms