RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SOGA3Q5TF21 947 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC55Q6ZSA7 311 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PGBD4Q96DM1 585 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 GNAT2P19087 354 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 METTL24Q5JXM2 366 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PROKR1Q8TCW9 393 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 MLST8Q9BVC4 326 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ENKD1Q9H0I2 346 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 NRP1O14786 923 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM24O15164 1050 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 FSBPO95073 299 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 RAPGEF3O95398 923 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ABHD16AO95870 558 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ADCY2Q08462 1091 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PTPAQ15257 358 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PRIMA1Q86XR5 153 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 LILRB2Q8N423 598 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 C7orf31Q8N865 590 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 GPR150Q8NGU9 434 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PDCD2LQ9BRP1 358 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 MTG2Q9H4K7 406 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 NCDNQ9UBB6 729 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 COL4A3Q01955 1670 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CBX4O00257 560 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 OPHN1O60890 802 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 STC2O76061 302 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CREB3L3Q68CJ9 461 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1841Q6NSI8 718 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 VRK3Q8IV63 474 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 UIMC1Q96RL1 719 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SOX7Q9BT81 388 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 OPA1O60313 960 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 RECQL4O94761 1208 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 GAAP10253 952 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SLC9A1P19634 815 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF460Q14592 562 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ZZZ3Q8IYH5 903 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 UNC5BQ8IZJ1 945 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TOR3AQ9H497 397 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 SORCS3Q9UPU3 1222 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 B3GALT2O43825 422 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 NUDT3O95989 172 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 GYPEP15421 78 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 TAP1Q03518 808 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC142Q17RM4 750 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3R6Q5UE93 754 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 CPT1CQ8TCG5 803 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 MYL10Q9BUA6 226 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-202ENST00000368205 HK1P19367 917 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 FLT3P36888 993 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 WNT3AP56704 352 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 IQSEC1Q6DN90 963 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 POFUT1Q9H488 388 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 ING3Q9NXR8 418 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 LAG3P18627 525 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 FAM214AQ32MH5 1076 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3C3Q8NEB9 887 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 SLC46A2Q9BY10 475 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 KCNH6Q9H252 994 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 AHRRA9YTQ3 701 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 ALDH1A2O94788 518 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 APOL3O95236 402 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRK-202ENST00000368205 JMJD7P0C870 316 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms