RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 AVPR1AP37288 418 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NRIP1P48552 1158 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 STX17P56962 302 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM133AQ8N9E0 248 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KIFAP3Q92845 792 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-201ENST00000348564 RIT2Q99578 217 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PARVGQ9HBI0 331 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BRD1O95696 1058 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ST3GAL1Q11201 340 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KCNB1Q14721 858 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYSM1Q5VVJ2 828 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 POTEGQ6S5H5 508 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 POTEEQ6S8J3 1075 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 VPS36Q86VN1 386 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TEX2Q8IWB9 1127 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL16Q8N461 479 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NEK9Q8TD19 979 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MTMR6Q9Y217 621 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC37AA6NMS7 1700 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 F5P12259 2224 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FAM170AA1A519 330 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 N4BP3O15049 544 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DAPK3O43293 454 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CTDNEP1O95476 244 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G4BP0C869 781 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PTMSP20962 102 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DDIT3P35638 169 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DNA2P51530 1060 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TROAPQ12815 778 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R5DQ14738 602 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 VPS52Q8N1B4 723 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 USP38Q8NB14 1042 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ACCSQ96QU6 501 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TCF25Q9BQ70 676 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BRD9Q9H8M2 597 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PANK4Q9NVE7 773 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PCDH10Q9P2E7 1040 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NCDNQ9UBB6 729 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ATP8B3O60423 1300 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CALUO43852 315 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP5P24588 427 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GRIK1P39086 918 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NNMTP40261 264 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RFC5P40937 340 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CETN2P41208 172 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 EVCP57679 992 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG1Q07617 926 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SLC24A5Q71RS6 500 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PPTC7Q8NI37 304 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 BHMTQ93088 406 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MAD2L2Q9UI95 211 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 MOSPD1Q9UJG1 213 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRA2Q96PE1 1338 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 E9PMD0 336 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NEMP1O14524 444 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GLUD1P00367 558 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 CTNNA2P26232 953 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 RAB27AP51159 221 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 SNX16P57768 344 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 GJA9P57773 515 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 PTK7Q13308 1070 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 NME8Q8N427 588 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-201ENST00000348564 APBB2Q92870 758 aa4.83□□□□□ -1.64
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