RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347077.8

ZNF546-201, Transcript of zinc finger protein 546, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF546, Length 7,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546-201ENST00000347077 ZAP70P43403 619 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 GUCY2FP51841 1108 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 LINC00523Q86TU6 105 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MYH6P13533 1939 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MYH11P35749 1972 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 RALBP11234 206 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 HORMAD1Q86X24 394 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 CXorf38Q8TB03 319 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 FCGR1AP12314 374 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 CDC27P30260 824 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 NUP107P57740 925 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 ITKQ08881 620 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 CENPPQ6IPU0 288 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MAGEB2O15479 319 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 COBLO75128 1261 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 RASSF9O75901 435 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 CYP2C8P10632 490 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 DDIT3P35638 169 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 MESDQ14696 234 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 LPAR1Q92633 364 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 PHF21AQ96BD5 680 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 ECT2Q9H8V3 914 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 C8orf4Q9NR00 106 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.4□□□□□ -1.38
ZNF546-201ENST00000347077 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ERVK-7P63135 1459 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 IL18RAPO95256 599 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 PLA2G4BP0C869 781 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SLC39A6Q13433 755 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ICE2Q659A1 982 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SLC35F6Q8N357 371 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 RFFLQ8WZ73 363 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 A0A1W2PQJ5 194 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SUPT3HO75486 399 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 EPHB1P54762 984 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 C16orf87Q6PH81 154 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 C11orf88Q6PI97 169 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 CNBD2Q96M20 576 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 MED15Q96RN5 788 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 KATNAL1Q9BW62 490 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 BTG4Q9NY30 223 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.4□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SLC2A3P11169 496 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SNX17Q15036 470 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 USP6NLQ92738 828 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SYBUQ9NX95 663 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TADA3O75528 432 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ITIH2P19823 946 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 RGS4P49798 205 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 RUNX1T1Q06455 604 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TP53BP2Q13625 1128 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 NLRP10Q86W26 655 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 SNX19Q92543 992 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.39□□□□□ -1.39
ZNF546-201ENST00000347077 DLC1Q96QB1 1528 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms