RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CCDC68Q9H2F9 335 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SLC26A4O43511 780 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GYPCP04921 128 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 COG2Q14746 738 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CCDC38Q502W7 563 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 LPXNO60711 386 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MYBP10242 640 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SLC18A3Q16572 532 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 UBE4BO95155 1302 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RAPH1Q70E73 1250 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GDAP1Q8TB36 358 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SNX12Q9UMY4 172 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SEC23AQ15436 765 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 AGPAT1Q99943 283 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PSMD14O00487 310 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TXNDC9O14530 226 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 NOL3O60936 208 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SPATA33Q96N06 139 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 BCAP29Q9UHQ4 241 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 STRIP2Q9ULQ0 834 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PDCLQ13371 301 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 HSPBP1Q9NZL4 362 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MMP19Q99542 508 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GINM1Q9NU53 330 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RNF181Q9P0P0 153 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 POLLQ9UGP5 575 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CERKQ8TCT0 537 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CFAP36Q96G28 342 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 VCXQ9H320 206 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 HPSEQ9Y251 543 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PFASO15067 1338 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MYL3P08590 195 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 UCHL3P15374 230 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 STYK1Q6J9G0 422 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TIPINQ9BVW5 301 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GSTA1P08263 222 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GSTA2P09210 222 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.143e-11■■■□□ 17.9
NISCH-201ENST00000345716 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PLS3P13797 630 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CA4P22748 312 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RPA1P27694 616 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 NTRK3Q16288 839 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CYP26A1O43174 497 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CHRNA3P32297 505 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ZNF185O15231 689 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 FMO5P49326 533 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 VSNL1P62760 191 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 STK33Q9BYT3 514 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF37A1IGU5 675 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 GYS1P13807 737 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 EFCAB13Q8IY85 973 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 MORC4Q8TE76 937 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 PFDN6O15212 129 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 DGAT1O75907 488 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 BBS5Q8N3I7 341 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 SLC37A4O43826 429 aa22.14■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TFDP2Q14188 446 aa22.14■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 TTC13Q8NBP0 860 aa22.14■■□□□ 1.14
NISCH-201ENST00000345716 KCND2Q9NZV8 630 aa22.14■■□□□ 1.14
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