RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 AFG1LQ8WV93 481 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GABRQQ9UN88 632 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GTH6 734 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 K7ENM7 598 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LGALS2P05162 132 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC26A2P50443 739 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SOX10P56693 466 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SP3Q02447 781 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KIF22Q14807 665 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ATP8B4Q8TF62 1192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 INTS13Q9NVM9 706 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PDXKO00764 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CALUO43852 315 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRPA1O75762 1119 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PPP1R37O75864 691 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MMP3P08254 477 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PEX3P56589 373 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ALCAMQ13740 583 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KSR1Q8IVT5 923 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.63□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 RTP1P59025 263 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HTRA3P83110 453 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CAP1Q01518 475 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NR1I3Q14994 352 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 BSNDQ8WZ55 320 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIM11Q96F44 468 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TAB2Q9NYJ8 693 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC16A4O15374 487 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MAFO75444 373 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NEBLO76041 1014 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ZNF286BP0CG31 522 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NPTX2P47972 431 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SMTNP53814 917 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 PRKCZQ05513 592 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CEP63Q96MT8 703 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MED4Q9NPJ6 270 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 NRBP1Q9UHY1 535 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRPC6Q9Y210 931 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CCDC189A1A4V9 331 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 CCDC169A6NNP5 214 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HBP1O60381 514 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ARL2P36404 184 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FLT3LGP49771 235 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 GTF2BQ00403 316 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DGKDQ16760 1214 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMC6Q7Z403 805 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TLK2Q86UE8 772 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIM74Q86UV6 250 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIM73Q86UV7 250 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 VSTM4Q8IW00 320 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TRIB2Q92519 343 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TMEM143Q96AN5 459 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 IFT74Q96LB3 600 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 ACCSQ96QU6 501 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 VPS16Q9H269 839 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.62□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CCR6-201ENST00000341935 TEX33O43247 280 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.1 ms