RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.3■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ZNF720Q7Z2F6 126 aa23.3■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 MAN1B1Q9UKM7 699 aa23.3■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 TBX21Q9UL17 535 aa23.3■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 DENND3A2RUS2 1198 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 CHRNA1P02708 482 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 EHHADHQ08426 723 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 MAPK6Q16659 721 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 FAM26DQ5JW98 314 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 DPF3Q92784 378 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 HPS3Q969F9 1004 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 KIFC3Q9BVG8 833 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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YBX1-201ENST00000321358 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ISM2Q6H9L7 571 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 USP38Q8NB14 1042 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 CDHR5Q9HBB8 845 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ARID2Q68CP9 1835 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 MGAT3Q09327 533 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 STK4Q13043 487 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 STIM1Q13586 685 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 HVCN1Q96D96 273 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 SQORQ9Y6N5 450 aa23.28■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 KIAA0355O15063 1070 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 ERLIN2O94905 339 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 GTF2BQ00403 316 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 MORC3Q14149 939 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 FIZ1Q96SL8 496 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 EXOC7Q9UPT5 735 aa23.27■■□□□ 1.32
YBX1-201ENST00000321358 GPR182O15218 404 aa23.26■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 CYP2C18P33260 490 aa23.26■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 MYBP10242 640 aa23.25■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 CCL23P55773 120 aa23.25■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.25■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TMEM206Q9H813 350 aa23.25■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 PAK2Q13177 524 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TMEM199Q8N511 208 aa23.24■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 KCNN1Q92952 543 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 MINDY3Q9H8M7 445 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 DACH1Q9UI36 760 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 GDAQ9Y2T3 454 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 UBE4BO95155 1302 aa23.24■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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YBX1-201ENST00000321358 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 MLKLQ8NB16 471 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 TMEM40Q8WWA1 233 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 FZD8Q9H461 694 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 EVPLQ92817 2033 aa23.23■■□□□ 1.31
YBX1-201ENST00000321358 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.23■■□□□ 1.31
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