RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295688.7

CCT3-201, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCT3, Length 2,150 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3-201ENST00000295688 SFI1A8K8P3 1242 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 P4HA2O15460 535 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CAND2O75155 1236 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SLITRK3O94933 977 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 KRT13P13646 458 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 VCAM1P19320 739 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CRKP46108 304 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NFIAQ12857 509 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PIGOQ8TEQ8 1089 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 DYDC2Q96IM9 177 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 THAP2Q9H0W7 228 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.02■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ASAP2O43150 1006 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 AGTP01019 485 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PRELPP51888 382 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SLMAPQ14BN4 828 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 LRCH2Q5VUJ6 765 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CCDC197Q8NCU1 140 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 IDI2Q9BXS1 227 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 MCM8Q9UJA3 840 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NR2E1Q9Y466 385 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ALG6Q9Y672 507 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.01■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NDUFB10O96000 172 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 MMP13P45452 471 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CYP2J2P51589 502 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PLTPP55058 493 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 GPC5P78333 572 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 BFSP1Q12934 665 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ARHGAP44Q17R89 818 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CBWD6Q4V339 395 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CBWD3Q5JTY5 395 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CBWD5Q5RIA9 395 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SLC5A5Q92911 643 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 EXOC3O60645 756 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PSMD10O75832 226 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PTGIRP43119 386 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SCTRP47872 440 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ITIH4Q14624 930 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SNCBQ16143 134 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SGSM3Q96HU1 749 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 WDR11Q9BZH6 1224 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 WNT8AQ9H1J5 351 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ERVK-5Q9HDB9 667 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PNMA2Q9UL42 364 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SNX24Q9Y343 169 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SIPA1L1O43166 1804 aa16■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 UBR3Q6ZT12 1888 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 DCDC2CA8MYV0 355 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CTNNA2P26232 953 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 XRCC4Q13426 336 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ALCAMQ13740 583 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ODR4Q5SWX8 454 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ZDHHC24Q6UX98 284 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ZFPM1Q8IX07 1006 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SYCP3Q8IZU3 236 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 FUKQ8N0W3 1084 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CCT6BQ92526 530 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 GLG1Q92896 1179 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 C8orf37Q96NL8 207 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 FIZ1Q96SL8 496 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CCDC134Q9H6E4 229 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 DNM1LO00429 736 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 RTN2O75298 545 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 MTA2O94776 668 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 GSTA1P08263 222 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 CHN1P15882 459 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 SNAP25P60880 206 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NEDD9Q14511 834 aa15.99■□□□□ 0.15
CCT3-201ENST00000295688 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms