RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RGL1Q9NZL6 768 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 AMACRQ9UHK6 382 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FANCGO15287 622 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 APBA3O96018 575 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PLS3P13797 630 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TNNI1P19237 187 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 STX2P32856 288 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SLC1A1P43005 524 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 UBXN2AP68543 259 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ATP11AP98196 1134 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CCT8L2Q96SF2 557 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SYNCQ9H7C4 482 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SCINQ9Y6U3 715 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 EMSYQ7Z589 1322 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 WDR64B1ANS9 1081 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 GUCY2CP25092 1073 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 PPP2R5CQ13362 524 aa9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 FYB2Q5VWT5 728 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 DEPTORQ8TB45 409 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 FBF1Q8TES7 1133 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SH3GL2Q99962 352 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 TMOD4Q9NZQ9 345 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 SNED1Q8TER0 1413 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 LAMB2P55268 1798 aa9.52□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 EPHB6O15197 1021 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TFRCP02786 760 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PSAPP07602 524 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MMP10P09238 476 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 NSMFQ6X4W1 530 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 BANK1Q8NDB2 785 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ERP44Q9BS26 406 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 EHD2Q9NZN4 543 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 GGA2Q9UJY4 613 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CEP57Q86XR8 500 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 SNX24Q9Y343 169 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 NCANO14594 1321 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 AFF2P51816 1311 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 TTI1O43156 1089 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 CCDC127Q96BQ5 260 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 NUP85Q9BW27 656 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 GINM1Q9NU53 330 aa9.51□□□□□ -0.89
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HERC3-201ENST00000264345 FAM196BA6NMK8 535 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 F8VZ95 297 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 ZNF263O14978 683 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TRIM66O15016 1216 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PIK3CAP42336 1068 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 PLCB3Q01970 1234 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 TRPC3Q13507 836 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 LDHDQ86WU2 507 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-201ENST00000264345 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.51□□□□□ -0.89
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