RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 REPS2Q8NFH8 660 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.34■□□□□ 0.85
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PDLIM4-201ENST00000253754 PLS3P13797 630 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 PPATQ06203 517 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 PNMA2Q9UL42 364 aa20.34■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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PDLIM4-201ENST00000253754 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.33■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 TMCO5BA8MYB1 307 aa20.33■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC16A4O15374 487 aa20.33■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 PPP2R5AQ15172 486 aa20.33■□□□□ 0.85
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGAP44Q17R89 818 aa20.33■□□□□ 0.85
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PDLIM4-201ENST00000253754 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.32■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNK3O14649 394 aa20.32■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.32■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 LMO3Q8TAP4 145 aa20.31■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.31■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.3■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 WDR64B1ANS9 1081 aa20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 PSMC5P62195 406 aa20.3■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 RPS6KA1Q15418 735 aa20.3■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 XKR9Q5GH70 373 aa20.3■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 PALB2Q86YC2 1186 aa20.3■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 C4orf19Q8IY42 314 aa20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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PDLIM4-201ENST00000253754 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 PEX10O60683 326 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 VAMP7P51809 220 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM193AP78312 1265 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 SP4Q02446 784 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO5Q75V66 913 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 MYPNQ86TC9 1320 aa20.29■□□□□ 0.84
PDLIM4-201ENST00000253754 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.29■□□□□ 0.84
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