RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC1Q9NV70 894 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PPFIA4O75335 1185 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R3AQ6IN85 833 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR59Q6PJI9 974 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ETNPPLQ8TBG4 499 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD4Q9NVX7 518 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 HPCAL4Q9UM19 191 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.79■■■□□ 2.2
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CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS2P05162 132 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR2P61160 394 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGA7Q13683 1181 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF20Q3BBV1 942 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 MOXD1Q6UVY6 613 aa28.78■■■□□ 2.2
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CAPNS1-201ENST00000246533 RTP1P59025 263 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX17Q15036 470 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 TTI2Q6NXR4 508 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A5Q92911 643 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 AK8Q96MA6 479 aa28.77■■■□□ 2.2
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM107BQ9H098 131 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNMB3Q9NPA1 279 aa28.77■■■□□ 2.2
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM60Q9H2L4 133 aa28.76■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CRACR2AQ9BSW2 395 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 CHMP2AO43633 222 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf61Q8IZ16 206 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BRB1 525 aa28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC31Q6UY01 552 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MMGT1Q8N4V1 131 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM58Q8NG06 486 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM10Q9UDY6 481 aa28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 VAV2P52735 878 aa28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.73■■■□□ 2.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV6Q9H1D0 765 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 JRKLQ9Y4A0 524 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG7O95352 703 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
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